Los órganos de gobierno de Fedea son el Patronato, la Comisión Ejecutiva y el Comité Científico. Cada uno de ellos, celebra al menos dos reuniones anuales para supervisar el funcionamiento de la fundación y asegurar el cumplimiento de sus objetivos. El Director Ejecutivo y el Subdirector de la Fundación actúan por delegación de los órganos de gobierno de la Fundación.
Patronato
- Presidente de Honor: Sr. D José Vilarasau Salat
- Presidente: Sr. D. José Ignacio Goirigolzarri Tellaeche
- Sr. D. José Luis Acea Rodriguez, BANCA MARCH
- Sr. D. Basilio Javier Aguirre Fernández, COLEGIO DE REGISTRADORES
- Sr. D. Pello Xabier Belausteguigoitia, BANCO BILBAO VIZCAYA ARGENTARIA
- Sra. Dña. Laura Berjano Pérez, ABERTIS INFRAESTRUCTURAS
- Sr. D. D. José Manuel Domínguez Martínez, UNICAJA
- Sr. D. Héctor Flórez Crespo, DELOITTE
- Sr. D. Antonio García Ferrer, FUNDACIÓN ACS
- Sr. D. Ángel Gavilán González, BANCO DE ESPAÑA
- Sr. D. Héctor Grisi Checa, SANTANDER
- Sr. D. Antonio Huertas Mejías, MAPFRE
- Sr. D. Miguel Jerez Méndez, FUNDACIÓN RAMÓN ARECES
- Sr. D. David Jiménez-Blanco Carrillo de Albornoz, BOLSA DE MADRID
- Sr.D. Federico Linares, EY
- Sr. D. Tomás Muniesa Arantegui, CAIXABANK
- Sr. D. Josep Oliu i Creus, BANCO SABADELL
- Sr.D. Mario Ruiz-Tagle, IBERDROLA ESPAÑA
- Sr. D. Salvador Sanchez-Terán, URIA MENÉNDEZ
- Sr. D. Óscar Calderón de Oya (Secretario)
Comisión Ejecutiva
- Sr. D. José Ignacio Goirigolzarri Tellaeche (Presidente)
- Sra. Dña. Ana Aguilar
- Sra. Dña. Laura Berjano Pérez
- Sr. D. Antoni Bru Angelats
- Sr. D. Sergio Corral Delgado
- Sr. D. Ángel Gavilán González
- Sr. D. Enric Fernández Martínez
- Sr. D. Gonzalo de Cadenas
- Sr. D. Juan del Alcázar Narváez
- Sr. D. Miguel Jerez Méndez
- Sr. D. Juan Antonio Mielgo Carizo
- Sra. Dña. Sofía Rodríguez Rico
- Sr. D. Jorge Sicilia Serrano
- Sr. D. Óscar Calderón de Oya (Secretario)
Director: Ángel de la Fuente
Subdirector: Ignacio Conde